Varför gör vi antibakteriell aktivitet
Vår forskning bedrivs i gränssnittet mellan kemi och biologi.
Vårt ultimata mål är att förstå och utforska naturens kemi och naturliga processer som kan vara användbara för läkemedelsupptäckt. Vi undersöker i synnerhet de grundläggande delarna av peptider med möjliga farmaceutiska och medicinska tillämpningar. Peptider och proteiner produceras i alla levande organismer för att uppfylla viktiga biologiska funktioner.
Därför skulle man kunna tro att de skulle utgöra en av de vanligaste typerna av läkemedelsämnen. Användningen av peptider och proteiner hindras emellertid på grund av deras brist på stabilitet. Vi har funnit att vissa växter producerar en cocktail av mycket ovanliga polypeptider som cykliseras huvud-mot-svans via amidbindningar.
Antibiotika och antibiotikaresistens
Dessa cykliska polypeptider, kända som cyklotider cyklo-peptiderär cirka 30 aminosyrarester långa och uppvisar en exceptionell kemisk och biologisk stabilitet. Detta förklaras delvis av deras cykliska ryggraden, men dessutom innehåller de sex konserverade cysteinrester som är involverade i tre disulfidbindningar. Tillsammans begränsar dessa funktioner det så kallade cykliska cystinknötmotivet CCKsom visas i figuren nedan.
Cyklotidernas centrala kärna består av tre disulfider, markerade i gult och representerade i "stick and ball" -läge i figuren nedan.
Peptider - kemisk biologi
Disulfidbindningen till vänster och höger och deras anslutande ryggrad markerad med grått bildar en ring genom vilken den tredje disulfidbindningen är gängad. Detta är cystinknuten, som tillsammans med den cykliska ryggraden definierar det cykliska cystinknötmotivet. Den cykliska cystinknuten gör cyklotider mycket lämpliga för proteintekniska tillämpningar.
Biologiskt aktiva peptidsekvenser kan framgångsrikt sättas in i det stabila cyklotidställningen. Infödda cyklotider visar också en mängd biologiska aktiviteter, såsom sammandragning av livmodern varför den första cyklotid kalata B1 upptäcktesoch anti-HIV och insekticid aktivitet. Vi har nyligen visat att de också har kraftiga cytotoxiska och antibakteriella effekter, som för närvarande följs upp av strukturaktivitetsstudier och studier av cyklotideffekt på artificiella cellmembran i form av liposomer.
För mer information, inklusive möjligheterna att göra studentprojekt i vår grupp. Du kan hitta mer information om cyklotider i synnerhet i Cybase, en databas avsedd för cykliska proteiner och cystinknutna peptider i allmänhet i The Knottin-databasen. Bihonungspeptider Honeybees är källan till många produkter som har använts inom traditionell medicin sedan antikens tider.
Dessa produkter har olika biologiska aktiviteter, och många av dem är cytotoxiska. I detta projekt fokuserar vi på isolering och identifiering av låg-abundanta bioaktiva peptider. Varför gör vi antibakteriell aktivitet forskargrupp kombinerar farmakognosi med mikrobiologi och fokuserar på prover från extrema mikromiljöer.
Antibiotika – aminoglykosider
Vi isolerar och identifierar mikroorganismerna och odlar dem i laborativ miljö. Mikrobiologidelen inkluderar makro- och mikroskopisk identifiering av mikroorganismer och antibiotikautvärdering. Detta inkluderar att införa nya bioaktiviteter i det stabila ramverket och att använda cyklotider som fordon för läkemedelstransport. Dessutom utformar vi också stabila cykliska peptider med antibakteriell aktivitet som uppfyller låg cytotoxicitet och resistanskänslighet, som alternativ varför gör vi antibakteriell aktivitet konventionella antibiotika.
Fast faspeptidsyntes, protein-NMR och masspektrometri är de tekniker som mest används i vår forskning. Hittills har en rad olika cyklotider testats för deras cytotoxiska aktivitet, och vi har bedömt aktiviteten hos cyklotidvarianter in vitro, och syftar till att undersöka struktur-aktivitetsförhållanden med hjälp av cytotoxicitet som en modellaktivitet. För närvarande finns det inga genomiska data tillgängliga, vilket innebär att deras genorganisation, expressionsfaktorer och evolution är okända.
För att underlätta sökandet efter nya cyklotider, öka produktionsutbytet och förståelsen för posttranskriptionella modifieringsmekanismer, inklusive möjlig rekombination, är denna information av bred intresse för fältet. Detta projekt syftar till att upptäcka nya anticancermedel från Egyptens medicinska växter. En serie växter har samlats in, identifierats och screenats mot humana cancer-celler.
De flesta av dessa växter härstammar från traditionell användning av beduiner i Sinai. Chamari Hettiarachchi, och i samarbete med Prof. Sunithi Gunasekera stöttas av det svenska forskningsrådets stipendieschema 'Swedish Research Links' Målet är att karaktärisera de bioaktiva beståndsdelarna i det traditionella ayurvediska medicinska systemet i Sri Lanka. Uppsala universitet Institution Institutionen för farmaceutisk biovetenskap Forskning Farmakognosi Peptider - kemisk biologi.
Antibiotika – karbapenemer
Uppsala universitet Undersidor för Uppsala universitet. Institutionen för farmaceutisk biovetenskap Undersidor för Institutionen för farmaceutisk biovetenskap. Utbildning Undersidor för Utbildning. Forskning Undersidor för Forskning. Avbildande masspektrometri. Farmaceutisk Bioinformatik. Farmaceutisk cellbiologi.